Overheersing van antilichaam-resistente SARS-CoV-2-varianten in doorbraakgevallen met vaccin uit het San Francisco Bay-gebied, Californië

Abstract

Associaties tussen doorbraakgevallen met vaccin en infectie door SARS coronavirus 2 (SARS-CoV-2) varianten zijn grotendeels onontdekt gebleven. Hier analyseerden we SARS-CoV-2 genoomsequenties en virale ladingen van 1.373 personen met COVID-19 uit de San Francisco Bay Area van 1 februari tot 30 juni 2021, waarvan 125 (9,1%) vaccindoorbraakinfecties waren. Volledig gevaccineerden hadden meer kans dan niet-gevaccineerden om geïnfecteerd te worden door varianten met mutaties geassocieerd met verminderde antistofneutralisatie (L452R, L452Q, E484K, en/of F490S) (78% versus 48%, p = 1,96e-08), maar niet door varianten geassocieerd met verhoogde besmettelijkheid (L452R en/of N501Y) (85% versus 77%, p = 0,092). Verschillen in virale belasting waren niet-significant tussen niet-gevaccineerde en volledig gevaccineerde personen in het algemeen (p = 0,99) en naar gelang de herkomst (p = 0,09 – 0,78). De virale belasting was significant hoger in symptomatische dan in asymptomatische gevallen van vaccindoorbraak (p < 0,0001), en symptomatische infecties van vaccindoorbraak hadden vergelijkbare virale belasting als niet-gevaccineerde infecties (p = 0,64). In 5 gevallen met beschikbare longitudinale monsters voor serologische analyses bleken vaccindoorbraakinfecties geassocieerd te zijn met lage of niet-detecteerbare neutraliserende antilichaamniveaus die toe te schrijven waren aan immunocompromisatietoestand of infectie door een antilichaamresistente lijn. Deze bevindingen suggereren dat gevallen van vaccindoorbraak bij voorkeur worden veroorzaakt door circulerende antilichaam-resistente SARS-CoV-2-varianten, en dat symptomatische doorbraakinfecties COVID-19 mogelijk even efficiënt kunnen overdragen als niet-gevaccineerde infecties, ongeacht de infecterende lijn.

Verklaring van concurrerende belangen

C.Y.C. is directeur van het UCSF-Abbott Viral Diagnostics and Discovery Center en ontvangt onderzoekssteun van Abbott Laboratories, Inc. E.F. en J.H.,Jr. zijn werknemers en aandeelhouders van Abbott Laboratories. E.T., A.Z., en S.T. zijn werknemers van Color Genomics. De andere auteurs verklaren geen concurrerende belangen te hebben.

Financieringsverklaring

Dit werk werd gefinancierd door US CDC Epidemiology and Laboratory Capacity (ELC) for Infectious Diseases Grant 6 NU50CK000539 aan het California Department of Public Health (M-K.M., C.H., D.A.W.), het Innovative Genomics Institute (IGI) van UC Berkeley en UC San Francisco (C.Y.C.), National Institutes of Health grant R33AI129455 (C.Y.C.), US Centers for Disease Control and Prevention contract 75D30121C10991 (C.Y.C.), en Heluna Health/California Department of Public Health contract 5NU50CK000539-01-12 (C.Y.C.).

Verklaringen van de auteur

Ik bevestig dat alle relevante ethische richtlijnen zijn gevolgd, en dat alle noodzakelijke IRB en/of ethische commissie goedkeuringen zijn verkregen.

Ja

De gegevens van de IRB/overheidsinstantie die goedkeuring of vrijstelling voor het beschreven onderzoek heeft verleend, staan hieronder vermeld:

Restant nasofaryngeale en/of oropharyngeale (NP/OP) monsters en plasmamonsters van in het laboratorium bevestigde SARS-CoV-2 positieve patiënten werden uit de klinische laboratoria van de UCSF gehaald en in een biobank opgeslagen totdat ze verwerkt waren. Resterende monsters werden gebiobanked en retrospectieve beoordelingen van medische dossiers voor relevante klinische en demografische metadata werden uitgevoerd onder een vrijstelling van toestemming en volgens protocollen die waren goedgekeurd door de UCSF Institutional Review Board (protocolnummers 10-01116, 11-05519). Geanonimiseerde monsters van communautaire COVID-19-tests werden verkregen van Color Genomics Laboratory als onderdeel van een onderzoekssamenwerking. Vaccin doorbraak gegevens die overeenkomen met de ongeïdentificeerde monsters van Color Genomics werden verkregen van het San Francisco Department of Public Health. Goedkeuring voor sequencing en analyse van deze gedeïdentificeerde monsters en metadata werd verkregen van de UCSF Institutional Review Board (protocol nummer 11-05519).

Alle benodigde toestemming van de patiënt/deelnemer is verkregen en de juiste institutionele formulieren zijn gearchiveerd.

Ja

Ik begrijp dat alle klinische onderzoeken en alle andere prospectieve interventionele onderzoeken geregistreerd moeten worden bij een door ICMJE goedgekeurd register, zoals ClinicalTrials.gov. Ik bevestig dat al het onderzoek dat in het manuscript wordt gerapporteerd, is geregistreerd en dat de registratie-ID van het onderzoek is vermeld (let op: als u een prospectief onderzoek post dat retrospectief is geregistreerd, geef dan een verklaring in het veld ’trial ID’ waarin u uitlegt waarom het onderzoek niet van tevoren is geregistreerd).

Ja

Ik heb alle relevante richtlijnen voor onderzoeksrapportage gevolgd en de relevante checklist(s) voor onderzoeksrapportage van het EQUATOR Netwerk en ander relevant materiaal geüpload als aanvullende bestanden, indien van toepassing.

Ja

Paper in verzameling COVID-19 SARS-CoV-2 preprints van medRxiv en bioRxiv

Bron:

Venice Servellita, Mary-Kate Morris, Alicia Sotomayor-Gonzalez, Amelia S. Gliwa, Erika Torres, Noah Brazer, Alicia Zhou, Katherine T. Hernandez, Madeline Sankaran, Baolin Wang, Daniel Wong, Candace Wang, Yueyuan Zhang, Kevin R Reyes, Dustin Glasner, Xianding Deng, Jessica Streithorst, Steve Miller, Edwin Frias, John Hackett Jr., Carl Hanson, Debra Wadford, Susan Philip, Scott Topper, Darpun Sachdev,  View ORCID ProfileCharles Y. Chiu

doi: https://doi.org/10.1101/2021.08.19.21262139

Now published in Nature Microbiology doi: 10.1038/s41564-021-01041-4


Bijlage van De Wereldgezondheidsorganisatie heeft…..

Beheerder Vincent W Schoers

Copyright © 2021 door Zorgdatjenietslaapt.nl. Toestemming tot gehele of gedeeltelijke herdruk wordt graag verleend, mits volledige creditering en een directe link worden gegeven.

Mijn lichaam is geen eigendom van de staat. Ik heb de uitsluitende en exclusieve autonomie over mijn lichaam en geen enkele politicus, ambtenaar of arts heeft het wettelijke of morele recht om mij te dwingen een niet-gelicentieerd, experimenteel vaccin of enige andere medische behandeling of procedure te ondergaan zonder mijn specifieke en geïnformeerde toestemming. De beslissing is aan mij en aan mij alleen en ik zal mij niet onderwerpen aan chantage door de overheid of emotionele manipulatie door de media, of zogenaamde celebrity influencers.

Geef een antwoord